Sistemca rabiš. Dobrega... Mislim da je bila pred časom odprta neka tema v kupim/iščem/delo: Iščem sistemskega administratorja, pa si jih imel tam kar nekaj omenjenih. Pošlji jim ZS, če so ti pripravljeni pomagati in koliko bi te to prišlo.
Sploh, če omenjajo root level compromise, bi ti predlagal da najprej zaženeš RKhunter-ja in preveriš md5 checksum binary datotek od ps/ls in podobne (mislim da ti to rkhunter že sam naredi). Morajo se ujemati z izvornimi, v nasprotnem primeru so modificirane in ne kažejo vseh procesov/datotek na sistemu. Hitro lahko odpraviš te modificirane binarye tudi z force reinstallom sistemskih paketov, ki vsebujejo te ukaze. Naprej postopaš z IPS, moduli za hardening phpja, apacheja, itd.
Verjetno če uporabljaš kak opensource sistem je brezpomensko najeti programerja, da ti gre čekirat vsa ta čreva od kode, pa popravljat neke random napake. Najprej moraš izvedeti kje prihaja do problemov, da lahko odpraviš stvar.