Pei sami domeni iz seo razlogov ni neke bistvene razlike. Razlika se pojavi pri direktnem vpisovanju strani, kjer bo zagotovo prišlo do kake zmešnjave. Pravtako "zelenodrevo.com" zgleda bolj smiselno. Ne pozabimo, da strani ne delamo samo za iskalnike ampak predovsem za ljudi.
Priporočam, da domeno vzameš tako, na kakršno boš optimiziral stran. Če boš kupil zelenodrevo.com, optimiziral pa na "drevo zeleno", ti domena ne bo prav nič koristla. Seveda domena pomaga, ni pa zelo bistvena. Če pa je slučajno zelenodrevo.com zasedeno, pa se lahko še vedno zatečeš kakemu modifikatorju in registriraš mojezelenodrevo.com, tezelenodrevo.com, zelenodrevosite.com, zelenadrevesa.com,... saj razumeš.
Kot je že @perunpro povedal, iskalni rezultati za "zeleno drevo" in "drevo zeleno" niso enaki. Bo pa google vseeno prikazal med 40-80% (odvisno od niza) rezultatov, ki so optimizirani na "zeleno drevo" tudi takrat ko notri vneseš "drevo zeleno". Gooogle ne popravlja samo slovnične napake ampak tudi "iskalne nesmisle".